為因應影響國家安全且日趨複雜的傳統與非傳統安全議題,本院設置「國家安全研究所」,強化相關領域研究。期望透過與相關部會及國內外學界、智庫的互動交流與對話,研提研究成果與建議,提供政府公部門與民間參考。本所研究領域涵蓋國家安全戰略、內外部安全環境、區域安全、戰爭法與國際法、非傳統安全威脅、非戰爭軍事行動、災害防救、動員與緊急應變、國際人道救援等。